Evropská unie vytipovala nejcennější přírodní území, která chce ochraňovat. V České republice se pro takové lokality vžil termín: „Evropsky významná lokalita (EVL)“. Tyto lokality na podnět EU vyhlašuje vláda.  Jedno takové území bylo naší vládou vyhlášeno v roce 2005 a bylo nazváno Labské údolí. To se rozprostírá od hranic SRN až k Děčínu.

V roce 2009 vláda projednávala rozšíření tohoto území až k Litoměřicím. Pro odpor zejména ministerstva dopravy byl tento záměr stažen s varováním, že toto území kvalitativně plně splňuje kritéria pro EVL a nelze tedy vyloučit reakci Evropské komise.

Nyní má před sebou vláda další kolo rozhodování o rozšíření této lokality. A znovu se střetává záměr výstavby vodních děl se záměrem EU chránit rozmanitost přírody. Nyní je však Česká republika pod tlakem EU. Neboť může být proti naší zemi zahájeno řízení u Evropského soudního dvora za neplnění směrnic a je pravděpodobné, že do doby rozšíření EVL nebudou přidělovány dotace.

Samotné rozšířením EVL Labské údolí vyvolává v České republice velké spory, neboť pokud by byla chráněna biodiverzita řeky Labe, museli by loďaři opustit svůj dlouhodobý záměr výstavby jezu na Labi a museli by začíst pracovat na bezjezové variantě splavnění Labe, jenž není tak komfortní a možná i účinná.